Bentuk kerja sama antara SMK Ma’arif 2 Temon dengan Universitas Negeri Yogyakarta adalah dengan saling mengarahkan lulusan SMK Ma’arif 2 Temon agar berminat melanjutkan study ke perguruan tinggi kususnya UNY.
Langkah awal yang dilakukan dengan membuat backling PMB UNY dan UNY untuk mempermudah akses informasi terbaru tentang UNY.